Esta comunicação é fundamental para a percepção e avaliação do meio que rodeia o ser humano, e para a capacidade de resposta aos estímulos ambientais. Apesar de serem poucos os neurónios no nosso cérebro com capacidade para produzir e libertar serotonina, existe um grande número de células que detectam esse neurotransmissor. Desse modo, a serotonina desempenha um importante papel no funcionamento do nosso sistema nervoso e existem numerosas doenças com alterações na actividade desse neurotransmissor.

A serotonina parece ter funções diversas, como o controle da liberação de algumas hormonas e a regulação do ritmo circadiano, do sono e do apetite, entre outras.

Em geral, os indivíduos deprimidos têm níveis baixos de serotonina no sistema nervoso central.