No entanto, embora sejam frequente nas áreas de trabalho mencionadas, eles podem estar presentes em todo o tipo de trabalho, quer seja este efectuado ao nível produtivo e industrial, quer ao nível dos serviços.

Define-se como microrganismo qualquer entidade microbiológica, celular ou não celular, capaz de replicação ou de transferência de material genético, incluindo vírus, viróides e células animais e vegetais.

Também os microrganismos geneticamente modificados se apresentam como factor de risco associado a agentes biológicos e alvo de uma atenção particular. Podem penetrar no organismo do homem por via digestiva, respiratória, olhos e pele, e são responsáveis por diversas doenças profissionais graves como a hepatite, meningite ou a SIDA, mas também menos graves como infecções intestinais ou simples gripes. 

Prevenção
Como estes microrganismos se adaptam melhor e se reproduzem mais em ambientes sujos, as medidas preventivas a tomar terão de estar relacionadas com:

• A rigorosa higiene dos locais de trabalho e dos trabalhadores;
• Destruição destes agentes por processos de elevação da temperatura (esterilização) ou uso de cloro;
• Uso de equipamentos individuais de protecção para evitar contacto directo com os microrganismos;
• Ventilação permanente e adequada;
• Manutenção e limpeza dos sistemas de ventilação;
• Manutenção e limpeza dos equipamentos de trabalho;
• Controle médico constante;
• Vacinação sempre que possível;
• Formação e informação dos trabalhadores;
• Sinalização de segurança, etc.

A verificação da presença de agentes biológicos em ambientes de trabalho é feita por meio de recolha de amostras de ar e de água, que são depois analisadas em laboratórios especializados. 

Microrganismos geneticamente modificados
Com a evolução científico-tecnológica que se tem processado ao nível da biologia, mais precisamente com a introdução dos microrganismos geneticamente modificados no âmbito do trabalho, torna-se fundamental estudar qual o grau de perigosidade que estes representam para o ser humano.

Um microrganismo geneticamente modificado (MGM) define-se por um microrganismo cujo material genético foi modificado de uma forma que não ocorre naturalmente por reprodução sexuada e ou por recombinação natural.

Tal como nos restantes agentes biológicos o modo de penetração dos microrganismos geneticamente modificados no organismo do homem pode ocorrer por via digestiva, respiratória, olhos e pele, podendo originar, igualmente, algumas das doenças já mencionadas. No entanto, a perigosidade elevada deste género de microrganismos advém, exactamente, do tipo de doenças desconhecidas que estes podem provocar no homem, e que este não tem ainda conhecimento suficiente para as controlar, ou até mesmo detectar.

A melhor maneira de assegurar o confinamento deste tipo de microrganismos será a adopção de boas práticas de trabalho microbiológicas, formação, equipamento de confinamento apropriado, concepção de instalações especiais e princípios de higiene e segurança no local de trabalho, tais como:

• Manutenção do nível de exposição a quaisquer MGM, quer no local de trabalho, quer no ambiente envolvente, o mais baixo possível;
• Adopção de medidas de controlo na fonte;
• Formação adequada do pessoal;
• Elaboração de procedimentos operacionais de forma a garantir a segurança;
• Elaboração de procedimentos específicos de desinfecção e disponibilização de desinfectantes eficazes para situações de disseminação de MGM;
• Implementação de sistemas seguros de armazenagem de equipamento e material de laboratório contaminados;
• Interdição da pipetagem à boca, entre outros.