O protocolo de colaboração entre a FCTUC e o CHUC visa proporcionar aos estudantes inscritos nas licenciaturas e mestrados da responsabilidade da FCTUC uma aproximação à vida ativa, através da realização de estágios curriculares, bem como proporcionar aos investigadores integrados nos Centros de Investigação da FCTUC ou nos seus Departamentos envolvidos em projetos de investigação em colaboração com o Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra, enquadramento institucional para a realização de tarefas de investigação conjuntas nas instalações do CHUC.

O objetivo desta cooperação institucional entre unidades orgânicas de instituições de ensino superior e unidades prestadoras de cuidados de saúde com unidades de investigação, tem como principal desígnio o avanço e a aplicação do conhecimento e da evidência científica para a melhoria da saúde através da investigação, do ensino na formação pré e pós-graduada, da criação de conhecimento e da sua aplicação na melhoria dos cuidados prestados à população.