A tiroidite granulomatosa subaguda (de células gigantes), que provavelmente se deve a um vírus, começa de forma mais brusca que a tiroidite de Hashimoto. A tiroidite granulomatosa subaguda aparece depois de uma infecção viral e começa com o que muitas pessoas chamam uma inflamação da garganta, mas na realidade trata-se de uma dor no pescoço, localizada na tiróide. A glândula tiróide torna-se cada vez mais dolorosa e o paciente, em geral, apresenta uma febre ligeira (37ºC a 38ºC). A dor pode deslocar-se de um lado para o outro do pescoço, espalhar-se à mandíbula e aos ouvidos e tornar-se mais forte quando se vira a cabeça ou no momento da deglutição. A tiroidite granulomatosa subaguda confunde-se no início com um problema dentário ou com uma infecção da garganta ou do ouvido.
A inflamação faz com que a glândula tiróide liberte uma quantidade excessiva de hormona tiróidea e, por conseguinte, apareça hipertiroidismo, quase sempre seguido de um hipotiroidismo transitório. É frequente que as pessoas com tiroidite granulomatosa subaguda se sintam muito cansadas.
A maioria dos doentes recupera por completo deste tipo de tiroidite. O mal diminui de forma espontânea em poucos meses, mas por vezes causa recaídas ou, raramente, provoca uma lesão bastante grave na glândula tiróide para causar um hipotiroidismo permanente.